| Les côtes rocheuses de Nuku-Hiva aux nombreuses cavités, grottes et tombants constituent des sites privilégiés d'exploration sous-marine. L'absence de récifs barrière explique l'abondance de la faune pélagique avec, notamment, les grands dauphins d'Électre, les requins marteau, ailerons blancs et requins fossoyeurs, raies manta et léopard, raies pastenague et raies marbrées. Ainsi, la pointe Motumano, au Sud-ouest de l'île, permet d'approcher les requins marteau à festons et les raies manta.
À l'Est de Taiohae, la grotte profonde d'Ekamako est habitée par de grandes raies pastenague côtoyant d'énormes langoustes.
Au bout de la baie du Contrôleur, le cap Tikapo dominé par des falaises où nichent des centaines de frégates, représente le site le plus riche en faune pélagique avec un rassemblement de centaines de dauphins d'Électre, proches de l'orque pygmée.
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